Bertentangan dengan spekulasi dan laporan online, Bayangan Assassin's Creed bukan merupakan pokok perdebatan sengit di kalangan pemerintah Jepang.
Sankei melaporkan bahwa perwakilan Partai NHK Satoshi Hamada secara resmi meminta kementerian pemerintah Jepang untuk mengomentari Assassin's Creed Shadows. Hamada dilaporkan mengutip kekhawatiran atas ketidakakuratan sejarah yang ditampilkan dalam Ubisoft permainan.
Menanggapi hal tersebut, Kementerian Luar Negeri Jepang mengatakan bahwa hal itu sama sekali bukan urusan mereka, sementara Kementerian Pendidikan memberikan tanggapan standar kepada Hamada, dengan mengatakan bahwa sebuah permainan tidak boleh melanggar “ketertiban umum dan moral.” Pernyataan Kementerian Pendidikan selanjutnya berbunyi bahwa “penanganan yang cermat diperlukan jika ada kecurigaan konten yang melanggar ketertiban umum dan moral.”
Meskipun beberapa pihak menganggap pertukaran ini sebagai sebuah hal yang besar, dosen Studi Internasional Universitas Kanda Jeffrey J. Hall menegaskan Twitter bahwa pertanyaan seperti yang diajukan Hamada lebih sering bersifat performatif daripada tidak. Terlebih lagi, Partai NHK sangat kecil sehingga hampir tidak signifikan dalam skema besar politik Jepang – status kelompok tersebut sebagai partai politik dicabut awal tahun ini pada bulan Januari ketika sayap Otsu dari Parlemen Nasional mengeluarkan dua anggota.
Tanggapan Kementerian Pendidikan Jepang dipandang sebagai sesuatu yang besar, padahal sebenarnya, hal itu berkaitan dengan perilisan game yang menampilkan kekerasan atau ketelanjangan yang berlebihan, menurut Hall. Pemikiran ini menyebabkan Dead Space dilarang dirilis di Jepang, misalnya, atau, yang lebih baru, The Callisto Protocol ditolak izinnya untuk dirilis pada akhir tahun 2022.
Oleh karena itu, Kementerian Pendidikan Jepang sepertinya tidak akan menyelidiki Assassin's Creed Shadows dalam waktu dekat karena tidak ada preseden untuk melakukannya, sementara pemerintah Jepang secara keseluruhan tidak menunjukkan minat sama sekali untuk menanggapi pertanyaan Perwakilan Hadama.
Ubisoft baru-baru ini meminta maaf karena menimbulkan kekhawatiran di kalangan penggemar Assassin's Creed Shadows di Jepangmenulis bahwa permainan tersebut terus berkembang untuk menyempurnakan ketidakakuratan seperti bendera dan arsitektur hingga peluncuran. Ia juga menulis bahwa apakah tokoh utama Yasuke adalah seorang samurai masih bisa diperdebatkan, meskipun banyak cendekiawan Jepang bersikeras bahwa ia benar-benar seorang samurai.